PythonコードをCythonで高速化する完全ガイド

この記事では、Pythonのコードを高速化するための手法として「Cython」を使用する方法について詳しく解説します。具体的なコード例、その詳細解説、および応用例を含めています。

目次

Cythonとは何か?

CythonはPythonとC言語のハイブリッドであり、PythonコードをC言語に変換して高速化を実現するツールです。特に数値計算やデータ処理の高速化を目指す場合に有用です。

PythonとC言語の違い

Pythonは動的型付け言語であり、実行速度が遅い傾向にあります。一方、C言語は静的型付け言語で、コンパイル後の実行速度が高いです。Cythonは、この2つの言語の良い点を組み合わせたツールです。

基本的なCythonの使い方

インストール

まずはCythonをインストールしましょう。以下のコマンドでインストールできます。

!pip install Cython

PythonコードのCython化

基本的なPythonコードをCythonで高速化するための手順を解説します。

# simple.py
def fib(n):
    """Fibonacci数を計算"""
    a, b = 0, 1
    for i in range(n):
        a, b = b, a + b
    return a

このPythonコードをCythonで高速化するには、`.pyx`という拡張子に変更します。

# simple.pyx
def fib(int n):
    """Fibonacci数を計算"""
    cdef int a = 0
    cdef int b = 1
    cdef int i
    for i in range(n):
        a, b = b, a + b
    return a

コンパイル方法

作成した`.pyx`ファイルをコンパイルする必要があります。

!cythonize -i simple.pyx

実践的な応用例

例1: 行列積の高速化

NumPyを使って行列積を計算する際にCythonを使って高速化を試みます。

# matrix_mult.pyx
import numpy as np
cimport numpy as np

def matrix_mult(np.ndarray[np.int_t, ndim=2] A, np.ndarray[np.int_t, ndim=2] B):
    cdef int i, j, k, m, n, p
    m = A.shape[0]
    n = A.shape[1]
    p = B.shape[1]
    cdef np.ndarray[np.int_t, ndim=2] C = np.zeros((m, p), dtype=np.int)
    for i in range(m):
        for j in range(p):
            for k in range(n):
                C[i, j] += A[i, k] * B[k, j]
    return C

例2: ファイルの行数カウント

テキストファイルの行数をカウントするプログラムもCythonで高速化可能です。

# line_count.pyx
def count_lines(filename):
    cdef int num = 0
    with open(filename, 'r') as f:
        for line in f:
            num += 1
    return num

まとめ

CythonはPythonコードを高速化する有用なツールです。インストール方法から基本的な使い方、さらには具体的な応用例までを解説しました。これを機に、Pythonコードのパフォーマンス向上を図ってみてください。

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